Racjonalista - Strona głównaDo treści
Hipoteza świata RNA

Ten wątek jest przedawniony

Działy Forum » Nauka
NapisanoAutorTytuł
26-02-2014 14:56gostyx (347 punktów)Hipoteza świata RNA
Mam pytanie od forumowiczów odnośnie hipotezy świata RNA.

Hipoteza ta w dużym skrócie i uproszczeniu głosi, że "na początku RNA stworzyło DNA i białka", oparte na prostej obserwacji, że DNA do replikacji potrzebuje białka (enzymu), a enzym potrzebuje DNA, żeby być zstyntetyzowany.

Znamy proces powodujący powstawanie deoksyrybonukleotydów z rybonukleotydów (cegiełki RNA zmieniane są w cegiełki DNA) - tylko ten proces też jest katalizowany enzymem - reduktazą rybonukleotydową (ang. RNR).

Cząsteczki RNA mogą wprawdzie być katalizatorami polimeryzacji (ba - pałnią nawet ważną rolę w syntezie białek - tRNA na przykład), ale białka o wiele lepiej pełnią tę funkcję. I tutaj mam pytanie: skoro tak, to w takim razie jak to się ma do hipotezy świata RNA - na czym zsyntetyzował się "pierwowzór RNR"?

Też na RNA?
Czy ktoś słyszał coś na ten temat?
Autor wątku ma uprawnienia do usuwania wypowiedzi, jeżeli łamią regulamin Forum lub znacznie odbiegają od tematu.

tom2010 (352 punktów)
Nie wiem czy zwróciłeś uwagę na łącze, które pojawiło się na głównej stronie Racjonalisty:

polish.ruv(*)e-zycia-we-Wszechswiecie-4558/
26-02-2014 18:34 
 Ocena 1 na 1
hamp (3461 punktów)
>polish.ruv(*)e-zycia-we-Wszechswiecie-4558/

Chciałbym zwrócić uwagę na potencjalną niekompetencję redaktorów tej strony. Artykuły nie zawierają żadnych źródeł/odnośników/bibliografii, często pojawiają się sensacje takie jak UFO czy magnetycznie aktywne piramidy... To ma być serwis dostarczający naukowych informacji? Plotki na plotkach. Ten artykuł pojawił się na fanpage'u Racjonalisty na FB zdobywając mnóstwo lajków i udostępnień...
26-02-2014 22:43 
 Ocena 1 na 1
gostyx (347 punktów)
>Nie wiem czy zwróciłeś uwagę na łącze, które pojawiło się na głównej stronie Racjonalisty:
>polish.ruv(*)e-zycia-we-Wszechswiecie-4558/

Dzięki, Ty mi zrwóciłeś na to uwagę. Ale po przeczytaniu tego artykułu zgodziłbym się z przedmówcą hampem: jak dla mnie za mało konkretów, a dużo sensacji obliczonej na efekt.

Ten mały sceptycyzm z mojej strony opiera się na poniższym:

Po pierwsze - moge zrozumieć, że artykuł pisany był przez laika i "żeby sprzedać newsa". Ale stara praktyka cytowania źródła jest również miłą praktyką, jeśli zaś tego nie ma - nie mogę zweryfikować tego, o czym mówi dziennikarz, a mogę mieć np. wiedzę w tym temacie większą niż on.

Po drugie - co to za konferencja, która odbywa się w ambasadzie jakiegoś państwa? Dlaczego nie zaprezentowali tego na jakiejś prestiżowej, ogólnoświatowej konferencji naukowej? Jeśli jest, tak jak mówią i mają wymierne wyniki - artykuł w "Science" albo "Nature" murowany i nic, tylko się cieszyć. Artykuł nie wspomina słowem o takich planach.

Po trzecie - zastanawia mnie wniosek zawarty w tytule artykułu: "Odkryto praprzyczynę pojawienia się życia we Wszechświecie". Artykuł o tytule sugerującym tak daleko idące wnioski zawiera słowa "pewne produkty" i "mogło powstać", nie wspominając już o zdaniu (wycięte dosłownie, może jedynie tłumacz coś pokręcił?) "napromieniowaniu protonami z substancją pochodzącą z meteorytów".

Podsumowując: albo mamy wyniki i stawiamy naprawdę mocną hipotezę/teorię "życie powstało w ten sposób, o jakim mówimy" oraz planujemy artykuły w czasopismach naukowych z najwyższej półki (ja bym się tym na miejscu badaczy pochwalił, a na miejscu dziennikarza - napisał o planowanych publikacjach, aby chociażby uwiarygodnić artykuł) albo nie mamy tak naprawdę nic i nasze prezezntacje to jedynie czcza gadanina nie wiadomo za bardzo o czym i po co.

True breakthroughs are the outcome of serendipity and are (by definition) unforeseen.
It is misguided to place too much faith in the funding of strategic, highly networked, business-like, results-driven research.
Axel D. Becke
Lengyel (2127 punktów)
>Czy ktoś słyszał coś na ten temat?

www.pan.poznan.pl/nauki/N_209_08_Figlerowicz.pdf
Poczytaj sobie, co potrafi RNA, może nabierzesz zaufania do tej hipotezy
26-02-2014 23:05 
 Ocena 1 na 1
gostyx (347 punktów)
>>Czy ktoś słyszał coś na ten temat?
>www.pan.poznan.pl/nauki/N_209_08_Figlerowicz.pdf
>Poczytaj sobie, co potrafi RNA, może nabierzesz zaufania do tej hipotezy

Ok, dzięki - przeczytałem.
Kilka uwag z mojej strony - może nabiorę, może nie nabiorę. Nie uważam, aby "zaufanie do hipotezy" było czynnikiem warunkującym jej prawdziwość. Wręcz odwrotnie - wyszukiwanie dziur w teorii jest czynnikiem warunkującym jakikolwiek postęp.

Artykuł ten średnio mnie przekonuje do czegokolwiek. Owszem, daje obszerny opis działania RNA, ale nie wyjaśnia, w jaki sposób pierwotne białka mogłyby być przez RNA kodowane i transkrybowane. Co więcej - sam artykuł nadmienia, że wśród różnego typu działalności RNA duży udział mają właśnie białka.

"Jedną z funkcji niekodujących RNA jest regulacja ekspresji genów poprzez udział
w epigenetycznej modyfikacji chromatyny. Dzięki temu cząsteczki RNA wpływają na
strukturę konkretnych domen chromosomalnych, a także całych chromosomów." - regulacja ekspresji genów to nie to samo, co jej umożliwianie. DNA nadal koduje białka, a RNA jest matrycą na która DNA jest w pierwszej kolejności transkrybowane - ok, nic nowego. Ja pytam, w jaki sposób możliwe byłoby kodowanie białek przez RNA bez udziału DNA?

"Wykazano, iż wprowadzenie do komórek C. elegans krótkich (około 20-nukleotydowych) dwuniciowych cząsteczek RNA, homologicznych do wybranego genu, prowadzi do jego całkowitego wyciszenia"
Skoro wprowadzenie RNA do komórki prowadzi do wyciszenia ekspresji genów, to w jaki sposób wspiera to lub ma to przełożenie na (powtórzę) możliwość bezpośredniego kodowania białek przez RNA, a o to mi chodziło w wątku?

True breakthroughs are the outcome of serendipity and are (by definition) unforeseen.
It is misguided to place too much faith in the funding of strategic, highly networked, business-like, results-driven research.
Axel D. Becke
julian (1206 punktów)
(zablokowany)
Hipoteza świata RNA, zdaniem niektórych informatyków, posiada szereg luk. Polecam artykuł PROBLEM ILOŚCI INFORMACJI W PROTOORGANIZMACH ŚWIATA RNA

www.google(*)ivay6SKA&bvm=bv.62286460,d.bGQ

Podstawowe zarzuty wobec tej hipotezy autora tegoż artykułu:
1.Hipoteza ta musi się zmierzyć z wieloma trudnościami, z których
jedną z istotniejszych jest problem przekazywania coraz większej informacji
zdolnej opisywać coraz bardziej złożone struktury żywe
. Problem ten, zwany jest
problemem katastrofy błędu. jego istota jest ogólniejsza i występuje w dowolnej hipotezie, która zakłada pojawienie się fazy replikacji - fazy, która choć może pojawiać się
na różnym etapie rozwoju, musi charakteryzować każdą hipotezę powstania życia,
gdyż replikacja, jako obserwowana we współczesnym świecie biologicznym, musiała
w jakiś sposób zaistnieć. Jednakże dla różnych hipotez wyniki tu prezentowane
przedstawiają różne stopnie trudności, przede wszystkim ze względu na akceptowalne
w ich ramach wartości dokładności replikacji: w przypadku świata RNA
dokładność replikacji musiała być najmniejsza, bowiem samoreplikacja pojawiła
się w warunkach abiotycznych i na wczesnych etapach nie mogła być wspierana
przez autokatalityczne działanie replikazy RNA, będącej hipotetycznym rybozymem
o kluczowym znaczeniu w dalszej ewolucji świata RNA


Problem katastrofy błędu samoreplikujących polinukleotydów RNA związany jest zaś z niską jakością replikacji
tych cząsteczek w warunkach abiotycznych. Tempo mutacji μ, występującej
w tego rodzaju replikacji przeprowadzanej w laboratoryjnej próbówce, w żadnym
z takich doświadczeń nie spada poniżej wartości 10-2 w przeliczeniu na pojedynczy
nukleotyd łańcucha. W związku z pojawiającymi się błędami replikacji następuje kumulacja
błędów, tym większa, im dłuższy jest łańcuch - gdyż mutacja działa w przybliżeniu
niezależnie na dowolny nukleotyd łańcucha

Kolejnym etapem świata RNA był prawdopodobnie etap protokomórek zawierających
kilka rodzajów genów, z których jednym zapewne była replikaza RNA.
Ponieważ geny te stanowiły niezależne jednostki replikujące - ze względu na brak
chromosomów - dlatego podział takich protokomórek powodował losowy przydział
materiału genetycznego do komórek potomnych.Okazuje się (wyniki
intensywnych symulacji komputerowych na podstawie
badań prowadzonych przez Myszora i Cyrana) że przy niezerowych prawdopodobieństwach
mutacji i przypadkowego rozpadu protokomórki, maksymalna liczba
różnych genów nie mogła przekroczyć zaledwie czterech. Ponadto jeżeli uwzględni się element losowości ilości replikowanych molekuł,
jaki na pewno miał miejsce w rzeczywistości, maksymalna liczba różnych genów
spada do trzech
. Biorąc pod uwagę, że procesy metaboliczne, nawet w wersji uproszczonej wymagają kilkunastu genów, to pokazuje, jak dziurawa jest hipoteza świata RNA.
Dodatkowym problemem jest istnienie samoreplikującej cząsteczki RNA. O ile wiem, nie udało się takiej stworzyć, a sama taka molekuła nie stworzy świata RNA, który wymaga wielu rybozymów, a tym samym wielu genów je warunkujących. Te rybozymy musiały być replikowane, ale przez co i z jaką wydajnością? Im dłuższe, tym więcej błędów w czasie powielania i zanik protoorganizmu.

Wróć do listy wątków działu Nauka
Aby pisać w tym wątku, musisz się zalogować

  

Zaloguj przez OpenID..
Jeżeli nie jesteś zarejestrowany/a - załóż konto..

Szukaj na Forum  Przewodnik  Regulamin i instrukcja obsługi Forum  Kolegium Moderatorów

 


[ Regulamin publikacji ] [ Bannery ] [ Mapa portalu ] [ Reklama ] [ Sklep ] [ Zarejestruj się ] [ Kontakt ]
Racjonalista © Copyright 2000-2018 (e-mail: redakcja | administrator)
Fundacja Wolnej Myśli, konto bankowe 101140 2017 0000 4002 1048 6365